Hollandiában az állam nem vitatja a Szcientológia Egyház vallásos státusát és természetét. Az évek során mind a végrehajtó hatalom, mind a bíróságok számos elismerést adtak ki a Szcientológiáról mint vallásról és a Szcientológia Egyházról mint vallási szervezetről, amely vallási szolgáltatásokat nyújt a híveinek. A Szcientológia Egyház vallási szervezetként és jogi személyként van bejegyezve.

Hollandiában a minisztériumok azzal fejezik ki, hogy elismerik a Szcientológia vallást, ahogyan az egyházat, a tagjait és a lelkészeit kezelik. Például az igazságügyi minisztérium megadja a Szcientológia-lelkészeknek a jogot arra, hogy börtönöket látogassanak, és tanácsot és segítséget nyújtsanak az elítélteknek; az oktatási minisztérium engedélyezi a szcientológusoknak, hogy saját iskolákat alapítsanak, hogy a vallási meggyőződésük szerint oktathassák a gyermekeiket; az adóhivatal pedig elfogadja a Szcientológia vallási státusát.

2007‑ben a bíróság helyt adott egy Szcientológia-hívő arra irányuló keresetének, hogy lánya otthon tanulhasson az ő és a lánya vallási meggyőződése alapján. A bíróság az Emberi Jogok Európai Bíróságának a Szcientológia Egyház kontra Moszkva ügyben hozott határozatára támaszkodott (2007. április 5., beadványszám: 18147/02) e határozat meghozatala során. 1991‑ben a vallási egyenlőség és a diszkriminációmentesség elveivel összhangban egy adóellenőrt arra utasítottak a felettesei, hogy ugyanúgy kezelje egy Szcientológia-lelkész jövedelemadó-bevallását, mint más vallások lelkészeiét.